Tham khảo Virus corona liên quan đến hội chứng hô hấp cấp tính nặng

  1. ↑ “ICTV Taxonomy history: Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus” (html). International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) (bằng tiếng Anh). Truy cập ngày 27 tháng 1 năm 2019. 
  2. ↑ Branswell H (ngày 9 tháng 11 năm 2015). “SARS-like virus in bats shows potential to infect humans, study finds”. Stat News. Truy cập ngày 20 tháng 2 năm 2020.  Đã bỏ qua tham số không rõ |url-status= (trợ giúp)
  3. ↑ Wong AC, Li X, Lau SK, Woo PC (tháng 2 năm 2019). “Global Epidemiology of Bat Coronaviruses”. Viruses 11 (2): 174. PMC 6409556. PMID 30791586. doi:10.3390/v11020174. Most notably, horseshoe bats were found to be the reservoir of SARS-like CoVs, while palm civet cats are considered to be the intermediate host for SARS-CoVs [43,44,45]. 
  4. 1 2 3 Ge XY, Li JL, Yang XL, Chmura AA, Zhu G, Epstein JH và đồng nghiệp (tháng 11 năm 2013). “Isolation and characterization of a bat SARS-like coronavirus that uses the ACE2 receptor”. Nature 503 (7477): 535–8. Bibcode:2013Natur.503..535G. PMC 5389864. PMID 24172901. doi:10.1038/nature12711. 
  5. ↑ “Virus Taxonomy: 2018 Release”. International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) (bằng tiếng Anh). Tháng 10 năm 2018. Truy cập ngày 13 tháng 1 năm 2019. 
  6. ↑ Woo PC, Huang Y, Lau SK, Yuen KY (tháng 8 năm 2010). “Coronavirus genomics and bioinformatics analysis”. Viruses 2 (8): 1804–20. PMC 3185738. PMID 21994708. doi:10.3390/v2081803. Figure 2. Phylogenetic analysis of RNA-dependent RNA polymerases (Pol) of coronaviruses with complete genome sequences available. The tree was constructed by the neighbor-joining method and rooted using Breda virus polyprotein. 
  7. 1 2 3 Coronaviridae Study Group of the International Committee on Taxonomy of Viruses (tháng 3 năm 2020). “The species Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus: classifying 2019-nCoV and naming it SARS-CoV-2”. Nature Microbiology. PMID 32123347. doi:10.1038/s41564-020-0695-z. 
  8. ↑ Kohen, Jon; Kupferschmidth, Kai (ngày 28 tháng 2 năm 2020). “Strategies shift as coronavirus pandemic looms”. Science 367 (6481): 962–963. PMID 32108093. doi:10.1126/science.367.6481.962. 
  9. ↑ Lau SK, Li KS, Huang Y, Shek CT, Tse H, Wang M và đồng nghiệp (tháng 3 năm 2010). “Ecoepidemiology and complete genome comparison of different strains of severe acute respiratory syndrome-related Rhinolophus bat coronavirus in China reveal bats as a reservoir for acute, self-limiting infection that allows recombination events”. Journal of Virology 84 (6): 2808–19. PMC 2826035. PMID 20071579. doi:10.1128/JVI.02219-09.  Đã bỏ qua tham số không rõ |doi-access= (trợ giúp)
  10. ↑ Kieny MP. “After Ebola, a Blueprint Emerges to Jump-Start R&D”. Scientific American Blog Network. Bản gốc lưu trữ ngày 20 tháng 12 năm 2016. Truy cập ngày 13 tháng 12 năm 2016.  Đã bỏ qua tham số không rõ |url-status= (trợ giúp)
  11. ↑ “LIST OF PATHOGENS”. World Health Organization. Bản gốc lưu trữ ngày 20 tháng 12 năm 2016. Truy cập ngày 13 tháng 12 năm 2016.  Đã bỏ qua tham số không rõ |url-status= (trợ giúp)
  12. ↑ Wong AC, Li X, Lau SK, Woo PC (tháng 2 năm 2019). “Global Epidemiology of Bat Coronaviruses”. Viruses 11 (2): 174. PMC 6409556. PMID 30791586. doi:10.3390/v11020174. See Figure 1. 
  13. ↑ Woo PC, Huang Y, Lau SK, Yuen KY (tháng 8 năm 2010). “Coronavirus genomics and bioinformatics analysis”. Viruses 2 (8): 1804–20. PMC 3185738. PMID 21994708. doi:10.3390/v2081803. See Figure 1. 
  14. ↑ Woo PC, Huang Y, Lau SK, Yuen KY (tháng 8 năm 2010). “Coronavirus genomics and bioinformatics analysis”. Viruses 2 (8): 1804–20. PMC 3185738. PMID 21994708. doi:10.3390/v2081803. Furthermore, subsequent phylogenetic analysis using both complete genome sequence and proteomic approaches, it was concluded that SARSr-CoV is probably an early split-off from the Betacoronavirus lineage [1]; See Figure 2. 
  15. ↑ “Coronaviridae - Figures - Positive Sense RNA Viruses - Positive Sense RNA Viruses (2011)”. International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) (bằng tiếng Anh). Truy cập ngày 6 tháng 3 năm 2020. See Figure 2. 
  16. ↑ Gouilh MA, Puechmaille SJ, Gonzalez JP, Teeling E, Kittayapong P, Manuguerra JC (tháng 10 năm 2011). “SARS-Coronavirus ancestor's foot-prints in South-East Asian bat colonies and the refuge theory”. Infection, Genetics and Evolution 11 (7): 1690–702. PMID 21763784. doi:10.1016/j.meegid.2011.06.021. Betacoronaviruses-b ancestors, meaning SARSr-CoVs ancestors, could have been historically hosted by the common ancestor of the Rhinolophidae and Hipposideridae and could have later evolved independently in the lineages leading towards Rhinolophidae and Hipposideridae betacoronaviruses. 
  17. ↑ Cui J, Han N, Streicker D, Li G, Tang X, Shi Z và đồng nghiệp (tháng 10 năm 2007). “Evolutionary relationships between bat coronaviruses and their hosts”. Emerging Infectious Diseases 13 (10): 1526–32. PMC 2851503. PMID 18258002. doi:10.3201/eid1310.070448. 
  18. ↑ Scripps Research Institute (ngày 17 tháng 3 năm 2020). “The COVID-19 coronavirus epidemic has a natural origin, scientists say - Scripps Research's analysis of public genome sequence data from SARS-CoV-2 and related viruses found no evidence that the virus was made in a laboratory or otherwise engineered”. EurekAlert!. Truy cập ngày 18 tháng 3 năm 2020. 
  19. ↑ Andersen, Kristian G. và đồng nghiệp (ngày 17 tháng 3 năm 2020). “The proximal origin of SARS-CoV-2”. Nature Medicine. doi:10.1038/s41591-020-0820-9. Truy cập ngày 18 tháng 3 năm 2020. 
  20. 1 2 3 Snijder EJ, Bredenbeek PJ, Dobbe JC, Thiel V, Ziebuhr J, Poon LL và đồng nghiệp (tháng 8 năm 2003). “Unique and conserved features of genome and proteome of SARS-coronavirus, an early split-off from the coronavirus group 2 lineage”. Journal of Molecular Biology 331 (5): 991–1004. PMID 12927536. doi:10.1016/S0022-2836(03)00865-9. The SARS-CoV genome is ∼29.7 kb long and contains 14 open reading frames (ORFs) flanked by 5′ and 3′-untranslated regions of 265 and 342 nucleotides, respectively (Figure 1). 
  21. 1 2 Fehr AR, Perlman S (2015). “Coronaviruses: an overview of their replication and pathogenesis”. Trong Maier HJ, Bickerton E, Britton P. Coronaviruses. Methods in Molecular Biology 1282. Springer. tr. 1–23. ISBN 978-1-4939-2438-7. PMC 4369385. PMID 25720466. doi:10.1007/978-1-4939-2438-7_1. 
  22. ↑ Fehr AR, Perlman S (2015). Maier HJ, Bickerton E, Britton P, biên tập. “An Overview of Their Replication and Pathogenesis; Section 2 Genomic Organization”. Methods in Molecular Biology (Springer) 1282: 1–23. ISBN 978-1-4939-2438-7. PMC 4369385. PMID 25720466. doi:10.1007/978-1-4939-2438-7_1. 
  23. ↑ McBride R, Fielding BC (tháng 11 năm 2012). “The role of severe acute respiratory syndrome (SARS)-coronavirus accessory proteins in virus pathogenesis”. Viruses 4 (11): 2902–23. PMC 3509677. PMID 23202509. doi:10.3390/v4112902. See Table 1. 
  24. ↑ Tang X, Li G, Vasilakis N, Zhang Y, Shi Z, Zhong Y, Wang LF, Zhang S (tháng 3 năm 2009). “Differential stepwise evolution of SARS coronavirus functional proteins in different host species”. BMC Evolutionary Biology 9: 52. PMC 2676248. PMID 19261195. doi:10.1186/1471-2148-9-52. 
  25. ↑ Narayanan, Krishna; Huang, Cheng; Makino, Shinji (tháng 4 năm 2008). “SARS coronavirus Accessory Proteins”. Virus Research 133 (1): 113–121. ISSN 0168-1702. PMC 2720074. PMID 18045721. doi:10.1016/j.virusres.2007.10.009. See Table 1. 
  26. 1 2 McBride R, Fielding BC (tháng 11 năm 2012). “The role of severe acute respiratory syndrome (SARS)-coronavirus accessory proteins in virus pathogenesis”. Viruses 4 (11): 2902–23. PMC 3509677. PMID 23202509. doi:10.3390/v4112902. 
  27. ↑ Snijder EJ, Bredenbeek PJ, Dobbe JC, Thiel V, Ziebuhr J, Poon LL và đồng nghiệp (tháng 8 năm 2003). “Unique and conserved features of genome and proteome of SARS-coronavirus, an early split-off from the coronavirus group 2 lineage”. Journal of Molecular Biology 331 (5): 991–1004. PMID 12927536. doi:10.1016/S0022-2836(03)00865-9. See Figure 1. 
  28. ↑ Goldsmith CS, Tatti KM, Ksiazek TG, Rollin PE, Comer JA, Lee WW và đồng nghiệp (tháng 2 năm 2004). “Ultrastructural characterization of SARS coronavirus”. Emerging Infectious Diseases 10 (2): 320–6. PMC 3322934. PMID 15030705. doi:10.3201/eid1002.030913. Virions acquired an envelope by budding into the cisternae and formed mostly spherical, sometimes pleomorphic, particles that averaged 78 nm in diameter (Figure 1A). 
  29. ↑ Neuman BW, Adair BD, Yoshioka C, Quispe JD, Orca G, Kuhn P và đồng nghiệp (tháng 8 năm 2006). “Supramolecular architecture of severe acute respiratory syndrome coronavirus revealed by electron cryomicroscopy”. Journal of Virology 80 (16): 7918–28. PMC 1563832. PMID 16873249. doi:10.1128/JVI.00645-06. Particle diameters ranged from 50 to 150 nm, excluding the spikes, with mean particle diameters of 82 to 94 nm; Also See Figure 1 for double shell. 
  30. ↑ Lai MM, Cavanagh D (1997). “The molecular biology of coronaviruses”. Advances in Virus Research 48: 1–100. ISBN 9780120398485. PMID 9233431. doi:10.1016/S0065-3527(08)60286-9. 
  31. ↑ Masters PS (ngày 1 tháng 1 năm 2006). The molecular biology of coronaviruses. Advances in Virus Research 66. Academic Press. tr. 193–292. ISBN 9780120398690. PMID 16877062. doi:10.1016/S0065-3527(06)66005-3. Nevertheless, the interaction between S protein and receptor remains the principal, if not sole, determinant of coronavirus host species range and tissue tropism. 
  32. ↑ Cui J, Li F, Shi ZL (tháng 3 năm 2019). “Origin and evolution of pathogenic coronaviruses”. Nature Reviews. Microbiology 17 (3): 181–192. PMID 30531947. doi:10.1038/s41579-018-0118-9. Different SARS-CoV strains isolated from several hosts vary in their binding affinities for human ACE2 and consequently in their infectivity of human cells76,78 (Fig. 6b) 
  33. ↑ Fehr AR, Perlman S (2015). Maier HJ, Bickerton E, Britton P, biên tập. “An Overview of Their Replication and Pathogenesis; Section 2 Genomic Organization”. Methods in Molecular Biology (Springer) 1282: 1–23. ISBN 978-1-4939-2438-7. PMC 4369385. PMID 25720466. doi:10.1007/978-1-4939-2438-7_1. See section: Virion Structure. 
  34. ↑ Chang CK, Hou MH, Chang CF, Hsiao CD, Huang TH (tháng 3 năm 2014). “The SARS coronavirus nucleocapsid protein--forms and functions”. Antiviral Research 103: 39–50. PMID 24418573. doi:10.1016/j.antiviral.2013.12.009. See Figure 4c. 
  35. ↑ Neuman BW, Kiss G, Kunding AH, Bhella D, Baksh MF, Connelly S và đồng nghiệp (tháng 4 năm 2011). “A structural analysis of M protein in coronavirus assembly and morphology”. Journal of Structural Biology 174 (1): 11–22. PMC 4486061. PMID 21130884. doi:10.1016/j.jsb.2010.11.021. See Figure 10. 
  36. ↑ Tok TT, Tatar G. “Structures and Functions of Coronavirus Proteins: Molecular Modeling of Viral Nucleoprotein.” (PDF). 
  37. ↑ Lal SK biên tập (2010). Molecular Biology of the SARS-Coronavirus. ISBN 978-3-642-03682-8. doi:10.1007/978-3-642-03683-5. 
  38. 1 2 Cui H, Gao Z, Liu M, Lu S, Mkandawire W, Mo S, Narykov O, Srinivasan S, Korkin D (tháng 1 năm 2020). “Structural genomics and interactomics of 2019 Wuhan novel coronavirus, 2019-nCoV, indicate evolutionary conserved functional regions of viral proteins.”. bioRxiv. doi:10.1101/2020.02.10.942136. 
  39. ↑ Wu F, Zhao S, Yu B, Chen YM, Wang W, Hu Y và đồng nghiệp (tháng 1 năm 2020). “Complete genome characterisation of a novel coronavirus associated with severe human respiratory disease in Wuhan, China.”. bioRxiv. doi:10.1101/2020.01.24.919183. 
  40. 1 2 Fehr AR, Perlman S (2015). “Coronaviruses: an overview of their replication and pathogenesis”. Trong Maier HJ, Bickerton E, Britton P. Coronaviruses. Methods in Molecular Biology 1282. Springer. tr. 1–23. ISBN 978-1-4939-2438-7. PMC 4369385. PMID 25720466. doi:10.1007/978-1-4939-2438-7_1. See section: Coronavirus Life Cycle – Attachment and Entry 
  41. 1 2 Simmons G, Zmora P, Gierer S, Heurich A, Pöhlmann S (tháng 12 năm 2013). “Proteolytic activation of the SARS-coronavirus spike protein: cutting enzymes at the cutting edge of antiviral research”. Antiviral Research 100 (3): 605–14. PMC 3889862. PMID 24121034. doi:10.1016/j.antiviral.2013.09.028. See Figure 2. 
  42. ↑ Heurich A, Hofmann-Winkler H, Gierer S, Liepold T, Jahn O, Pöhlmann S (tháng 1 năm 2014). “TMPRSS2 and ADAM17 cleave ACE2 differentially and only proteolysis by TMPRSS2 augments entry driven by the severe acute respiratory syndrome coronavirus spike protein”. Journal of Virology 88 (2): 1293–307. PMC 3911672. PMID 24227843. doi:10.1128/JVI.02202-13. The SARS-CoV can hijack two cellular proteolytic systems to ensure the adequate processing of its S protein. Cleavage of SARS-S can be facilitated by cathepsin L, a pH-dependent endo-/lysosomal host cell protease, upon uptake of virions into target cell endosomes (25). Alternatively, the type II transmembrane serine proteases (TTSPs) TMPRSS2 and HAT can activate SARS-S, presumably by cleavage of SARS-S at or close to the cell surface, and activation of SARS-S by TMPRSS2 allows for cathepsin L-independent cellular entry (26,–28). 
  43. ↑ Zumla A, Chan JF, Azhar EI, Hui DS, Yuen KY (tháng 5 năm 2016). “Coronaviruses - drug discovery and therapeutic options”. Nature Reviews. Drug Discovery 15 (5): 327–47. PMID 26868298. doi:10.1038/nrd.2015.37. S is activated and cleaved into the S1 and S2 subunits by other host proteases, such as transmembrane protease serine 2 (TMPRSS2) and TMPRSS11D, which enables cell surface non-endosomal virus entry at the plasma membrane. 
  44. ↑ Li Z, Tomlinson AC, Wong AH, Zhou D, Desforges M, Talbot PJ và đồng nghiệp (tháng 10 năm 2019). “The human coronavirus HCoV-229E S-protein structure and receptor binding”. eLife 8. PMC 6970540. PMID 31650956. doi:10.7554/eLife.51230. 
  45. 1 2 3 Fehr AR, Perlman S (2015). “Coronaviruses: an overview of their replication and pathogenesis”. Trong Maier HJ, Bickerton E, Britton P. Coronaviruses. Methods in Molecular Biology 1282. Springer. tr. 1–23. ISBN 978-1-4939-2438-7. PMC 4369385. PMID 25720466. doi:10.1007/978-1-4939-2438-7_1. See Table 2. 
  46. ↑ Masters PS (ngày 1 tháng 1 năm 2006). “The molecular biology of coronaviruses”. Advances in Virus Research (Academic Press) 66: 193–292. ISBN 9780120398690. PMID 16877062. doi:10.1016/S0065-3527(06)66005-3. See Figure 8. 
  47. 1 2 3 Fehr AR, Perlman S (2015). “Coronaviruses: an overview of their replication and pathogenesis”. Trong Maier HJ, Bickerton E, Britton P. Coronaviruses. Methods in Molecular Biology 1282. Springer. tr. 1–23. ISBN 978-1-4939-2438-7. PMC 4369385. PMID 25720466. doi:10.1007/978-1-4939-2438-7_1. See section: Replicase Protein Expression 
  48. ↑ Sexton NR, Smith EC, Blanc H, Vignuzzi M, Peersen OB, Denison MR (tháng 8 năm 2016). “Homology-Based Identification of a Mutation in the Coronavirus RNA-Dependent RNA Polymerase That Confers Resistance to Multiple Mutagens”. Journal of Virology 90 (16): 7415–28. PMC 4984655. PMID 27279608. doi:10.1128/JVI.00080-16. Finally, these results, combined with those from previous work (33, 44), suggest that CoVs encode at least three proteins involved in fidelity (nsp12-RdRp, nsp14-ExoN, and nsp10), supporting the assembly of a multiprotein replicase-fidelity complex, as described previously (38). 
  49. 1 2 Fehr AR, Perlman S (2015). “Coronaviruses: an overview of their replication and pathogenesis”. Trong Maier HJ, Bickerton E, Britton P. Coronaviruses. Methods in Molecular Biology 1282. Springer. tr. 1–23. ISBN 978-1-4939-2438-7. PMC 4369385. PMID 25720466. doi:10.1007/978-1-4939-2438-7_1. See section: Corona Life Cycle – Replication and Transcription 
  50. ↑ Fehr AR, Perlman S (2015). “Coronaviruses: an overview of their replication and pathogenesis”. Trong Maier HJ, Bickerton E, Britton P. Coronaviruses. Methods in Molecular Biology 1282. Springer. tr. 1–23. ISBN 978-1-4939-2438-7. PMC 4369385. PMID 25720466. doi:10.1007/978-1-4939-2438-7_1. See Figure 1. 
  51. 1 2 Fehr AR, Perlman S (2015). “Coronaviruses: an overview of their replication and pathogenesis”. Trong Maier HJ, Bickerton E, Britton P. Coronaviruses. Methods in Molecular Biology 1282. Springer. tr. 1–23. ISBN 978-1-4939-2438-7. PMC 4369385. PMID 25720466. doi:10.1007/978-1-4939-2438-7_1. See section: Coronavirus Life Cycle – Assembly and Release 

Liên quan

Tài liệu tham khảo

WikiPedia: Virus corona liên quan đến hội chứng hô hấp cấp tính nặng http://www.bcgsc.ca/bioinfo/SARS/ http://adsabs.harvard.edu/abs/2003Sci...300.1394R http://adsabs.harvard.edu/abs/2003Sci...300.1399M http://adsabs.harvard.edu/abs/2006PNAS..10312546Y http://adsabs.harvard.edu/abs/2013Natur.503..535G //www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1531645 //www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1563832 //www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2676248 //www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2720074 //www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2826035